യു☆ഗി☆ഓ! "ദി ഫാന്റം" എന്നറിയപ്പെടുന്ന നിഗൂഢ വിനോദ ഡ്യൂലിസ്റ്റായ യുയുയ സകാക്കിയെ ചുറ്റിപ്പറ്റിയാണ് ആർക്ക്-വി കേന്ദ്രീകരിച്ചിരിക്കുന്നത്, ഒപ്പം അദ്ദേഹത്തിന്റെ മറ്റ് മൂന്ന് വ്യക്തിത്വങ്ങളും: യുവോ, യുയുഗോ, യൂറി. അവരുടെ സോളിഡ് വിഷൻ വിത്ത് മാസ് സിസ്റ്റം ഹാക്ക് ചെയ്തതിന് ലിയോ കോർപ്പറേഷൻ അദ്ദേഹത്തെ പിന്തുടരുകയും അത് സ്വന്തം ആവശ്യത്തിനായി ഉപയോഗിക്കുകയും ചെയ്തു.
ഒളിച്ചോടുന്നതിനിടയിൽ, പാപ്പരത്വത്തിന്റെ വക്കിലായിരുന്ന സിയു സോ ഡ്യുവൽ സ്‌കൂളിലെ പ്രിൻസിപ്പലിന്റെ മകൾ യൂസു ഹിറാഗിയെ അവൻ കണ്ടുമുട്ടുകയും അവളുടെ സ്കൂളിൽ അധ്യാപികയാകാനുള്ള കരാറിൽ യുവയയെ കബളിപ്പിക്കുകയും ചെയ്തു. എന്നിരുന്നാലും, യുയയ്‌ക്ക് സ്കൂളിൽ പഠിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്നതിനുമുമ്പ്, അവൻ ആദ്യം കണ്ടെത്തേണ്ടത് ജെനസിസ് ഒമേഗ ഡ്രാഗൺ എന്ന ഒരു കാർഡ് കണ്ടെത്തണം, അത് ലോകത്തിന്റെ വിധി നിർണ്ണയിക്കും, അത് അവന്റെ ചിതറിപ്പോയ ഓർമ്മകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു.
നഗരത്തിലുടനീളമുള്ള സോളിഡ് വിഷൻ സിസ്റ്റത്തിന്റെ ഭൂരിഭാഗവും ആധിപത്യം പുലർത്തുന്ന ലിയോ കോർപ്പറേഷൻ, അതിന്റെ പ്രസിഡന്റ് റെയ്ജി അകബയുടെ നേതൃത്വത്തിലുള്ള മിയാമി സിറ്റിയുടെ ഇതര പതിപ്പിലാണ് കഥ ഒരുക്കിയിരിക്കുന്നത്. കമ്പനിയുടെ സോളിഡ് വിഷൻ വൻതോതിലുള്ള വ്യാപനം "ആക്ഷൻ ഡ്യുയലുകൾ"ക്ക് ജന്മം നൽകി എന്ന് മാത്രമല്ല, ജീവൻ രക്ഷിക്കുന്നതിനും ദുരന്തമുണ്ടായാൽ നാശനഷ്ടങ്ങൾ പരിഹരിക്കുന്നതിനും നഗരത്തെ മെച്ചപ്പെടുത്താനും സഹായിക്കുന്നു, ഇത് അത്യന്താപേക്ഷിതമാണ്.
